Científicos europeos crean un nuevo programa informático de código libre para las biociencias

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Científicos europeos crean un nuevo programa informático de código libre para las biociencias El procesamiento de datos de imágenes biológicas nunca ha sido más sencillo gracias a un nuevo programa informático de código libre para la visualización, el tratamiento y el análisis de imágenes tridimensionales creado por un equipo de investigadores alemanes y finlandeses. FUENTE | CORDIS: Servicio de Información en I+D Comunitario 29/06/2012

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El software, resultado de diez años de trabajo y llamado BioImageXD, facilita el análisis de la función de células y tejidos, por ejemplo el desplazamiento de las moléculas por las superficies celulares y su unión. En la revistaNature Methods se ha publicado un artículo sobre este trabajo, financiado en parte por una subvención amparada en el Séptimo Programa Marco (7PM) de la Unión Europea. Los investigadores, procedentes de Turku y Jyväskylä (Finlandia) y Dresde (Alemania), imprimen así un gran impulso al sector dedicado a las ciencias de la vida, al proporcionar un programa informático que permite el análisis de la composición de superficies celulares. También permite observar la propagación de células cancerosas en un entorno tridimensional y determinar la eficacia con que virus y fármacos dirigidos se introducen en las células, un logro sin precedentes. La investigación en los campos de las biociencias y la biomedicina no deja de ganar brío gracias a los trabajos que se están realizando en imaginería celular y tisular empleando innovadores microscopios especializados. Las técnicas más avanzadas hacen posible un estudio más a fondo de células vivas. Sin embargo, para que se puedan mostrar adecuadamente, las imágenes microscópicas se tienen que transformar en modelos tridimensionales. Así pues, aunque dichas imágenes tridimensionales ofrecen información fundamental, para contar con datos científicos fiables se necesitan valores numéricos que puedan emplearse en cálculos matemáticos aplicados a su vez a extensos corpus de datos.  En este contexto es donde cobra sentido la labor de dichos científicos alemanes y finlandeses, quienes han elaborado especificaciones precisas del software para procesar datos de imagen. Partieron de la premisa de que el programa estuviera basado en código libre al que pudieran acceder fácilmente todo tipo de investigadores, y así es como surgió BioImageXD. Este recurso ayudará a generar métodos analíticos radicalmente nuevos, procesar innumerables imágenes de forma simultánea y analizar millones de moléculas. Según sus creadores, las pruebas comparativas que realizaron mostraron que BioImageXD es más rápido y preciso que otros programas similares. La labor de creación de esta herramienta comenzó hace aproximadamente una década de manos de un equipo de investigación de la Universidad de Jyväskylä dirigido por Jyrki Heino. En este tiempo, los investigadores han cooperado para racionalizar y optimizar el software. Al cargo de las tareas de desarrollo, en el marco del proyecto, estuvo Pasi Kankaanpää, que en la actualidad trabaja en el Centro de Biotecnología de Turku como coordinador del «Centro de Imagen Celular» (Cell Imaging Core) de Finlandia.  El trabajo contó también con el apoyo de la Academia de Finlandia y de la Agencia Finlandesa de Financiación de la Tecnología y la Innovación. http://www.bioimagexd.net/ What is BioImageXD? BioImageXD is a free open source software project for analyzing, processing and visualizing of multi dimensional microscopy images. It's a collaborative project, designed and developed by microscopists, cell biologists and software engineers from the Universities of Jyväskylä and Turku in Finland, Max Planck Institute CBG in Dresden, Germany and collaborators worldwide. Implementation BioImageXD is written in Python and C++, using wxPython for the GUI, and leverages the power of the Visualization Toolkit (VTK) for multi dimensional image processing and 3D rendering. BioImageXD also uses the Insight Segmentation and Registration Toolkit (ITK) for segmentation and other image processing tasks. BioImageXD works on Linux (or theoretically any UNIX-like OS with wxPython, VTK and ITK), Mac OS X 10.6/10.7, and Windows XP, Vista and 7. The first Windows beta version of BioImageXD was released on the 9th February of 2006. See the download section for releases of the software. BioImageXD main features BioImageXD is a multi-purpose post-processing tool for bioimaging. The software can be used for simple visualization of multi-channel temporal image stacks to complex 3D rendering of multiple channels at once. Animations of 3D renderings can be created using flying paths or keyframes. BioImageXD has basic image adjustment operations and a collection of noise reduction methods. Processing methods are accompanied with a selection of segmentation methods. Segmentation results can be analysed for tens of parameters or used for motion tracking. Other quantitative analysis methods include for instance voxel and object colocalization methods and internalization analysis. All processing and analysis methods can be build into pipelines and run for hundreds of datasets at once in batch processor. Download The latest and older versions of the software are always available at the SourceForge page. The bug tracker can also be found there, please use it. The latest packages of the software are: Windows 64-bit binary installerDownload BioImageXD 1.0 Release Candidate 3 (r1789) Windows 32-bit binary installerDownload BioImageXD 1.0 Release Candidate 3 (r1789) Linux 64-bit packageDownload BioImageXD 1.0 Release Candidate 3 (r1789) Mac OS X 10.6/10.7 64-bit packageDownload BioImageXD 1.0 Release Candidate 3 (r1789) Installation instructions, Windows Windows packages are distributed as installers. Just run the installer and follow coming instructions to install BioImageXD to your system. You might need system administrator rights depending on your system settings. Installation instructions, Linux Linux package is not yet distributed as installer and it has prerequisite of Python 2.6 and wxPython 2.8.x installed in the system. To install BioImageXD on Linux, download the Linux package and extract it to the directory where you want to install BioImageXD. Then follow instructions on readme_linux.txt to set LD_LIBRARY_PATH. After setting that environment variable, you are ready to run BioImageXD using command python BioImageXD.py. Installation instructions, Mac OSX Mac OSX package is not yet distributed as disk image, we are working on it. Also the Mac OSX package currently uses different version of wx GUI library than Windows or Linux packages, so there can be some GUI related bugs in OSX version. To install and use BioImageXD in Mac OSX, you need to have at least a basic knowledge of shell (terminal.app). Mac OSX 10.6/10.7 package requires Python 2.7 installed in the system, everything else is included in the package. After you have downloaded the BioImageXD package and extracted it (in terminal use command tar xzf BXD_package_name.tar.gz), read file readme_osx.txt for instructions to set DYLD_LIBRARY_PATH. If you have extracted BioImageXD to /Users/username/BioImageXD then for instance you only need to set the following two lines to file /Users/username/.bash_profile: BXD_PATH=/Users/username/BioImageXD export DYLD_LIBRARY_PATH=$DYLD_LIBRARY_PATH:${BXD_PATH}/Libraries/:${BXD_PATH}/Libraries/python2.7/site-packages/vtkbxd/:${BXD_PATH}/Libraries/vtk-5.6/:${BXD_PATH}/Libraries/InsightToolkit/ After that BioImageXD can be launched in the BioImageXD directory using command python2.7 BioImageXD.py in every new terminal application. Source codeYou can access the source code through the SourceForge subversion service. The repository can be accessed at the following URL: https://bioimagexd.svn.sourceforge.net/svnroot/bioimagexd/bioimagexd/trunk. Sample data Sample data can be downloaded from SourceForge. Sample data package includes one 3D and one 4D LSM stack of two channels. Manual Both getting started guide and manual of BioImageXD are available. We recommend new users to first try getting started guide which is newer, up-to-date and more descriptive.Getting started guide is also included in BioImageXD software packages. Manual is old and not up-to-date, but has some in depth information (like descriptions of colocalization results) not available in getting started guide.

El Sentido de las bibliotecas en la sociedad.

Por: LUZ ORDÓÑEZ Socióloga y Comunicadora Social. epri.cci@gmail.com / www.uramanta.org | 28/06/2012 | Ed. Imp.

 

El próximo 30 de junio, se conmemora el “Día del bibliotecario boliviano” impulsado por el III congreso de Bibliotecología, Archivística y Museología el año 2006, e instituido por Resolución Ministerial 511/07, en homenaje al decreto, dispuesto por el Mariscal Andrés de Santa Cruz y Calahumana de crear bibliotecas públicas en Bolivia en 1830. 

En su tiempo se instauró con la visión de fortalecer el crecimiento integral, fomento a la lectura y formación de los ciudadanos, aunque debido a las condiciones sociales propias de la época, era un privilegio para algunas personas, asistir a una de ellas. Sin embargo poco a poco estos espacios se fueron ampliando y democratizando en su uso, a medida que la educación, el alfabetismo y la implementación de diferentes políticas sociales fueron extendiéndose en el país. 

Un bibliotecario es un gestor cultural y una biblioteca es un espacio de información y saber, acumulado durante varios años y siglos de nuestra historia, compartiendo a los lectores un conocimiento perfeccionado a través del tiempo. Cada una de nuestras bibliotecas deposita una vasta información que se constituye en parte del patrimonio cultural de nuestro país, transmitido de generación en generación, su utilización nos permite comprender el por qué de las cosas, identificar problemas y plantear soluciones. 

En la actualidad mantener abierta una biblioteca se convierte en un verdadero desafío, frente actitudes de algunas personas que cuestionando la funcionalidad de una biblioteca, dentro de una unidad educativa de nuestra ciudad, pretendan cerrarla, bajo el pretexto de que “no hay muchos usuarios” y que frente al internet la biblioteca, estaría quedando obsoleta, ahorrando de esa forma los presupuestos para su mantenimiento y orientando esos recursos a la compra de un equipo de sonido, que según evalúan, sería más útil para los estudiantes. La función social de una biblioteca no ha culminado ante la aparición de nuevas tecnologías, el internet es solamente un medio más, en cambio las bibliotecas son puntos culturales de referencia, económica, social, histórica, política, religiosa. etc.

Una biblioteca cumple diferentes funciones dentro la sociedad, entre ellas la educación, pues constituye un apoyo complementario al trabajo que vienen desarrollando los profesores en el aula, incentivando la lectura; también cumple una función socializadora, no solamente de conocimiento, sino también crea una dinámica de intercambio entre autor y lector; por otro lado, es un espacio de transmisión cultural, porque proporciona conocimientos y saberes, ya sea locales o internacionales, es una ventana hacia el mundo; y finalmente cumple con la función recreativa, mediante actividades lúdicas y de exploración promueve hábitos de lectura. 
Fuente:http://www.opinion.com.bo/opinion/articulos/2012/0628/noticias.php?id=61740

June 29, 2012 Books Update

On the Cover of Sunday's Book Review 'America the Philosophical' By CARLIN ROMANO Reviewed by ANTHONY GOTTLIEB Carlin Romano's ambitious book argues that today's America is the best place there has ever been to do philosophy, surpassing even the Athens of Socrates, Plato and Aristotle. Also in the Book Review 'Thomas Hart Benton: A Life' By JUSTIN WOLFF Reviewed by HOLLAND COTTER Justin Wolff's look at the life of the painter Thomas Hart Benton doesn't shy away from ambiguity. 'A Disposition to Be Rich' By GEOFFREY C. WARD Reviewed by T. J. STILES Geoffrey C. Ward's great-grandfather, who ran a pyramid scheme, was the Bernie Madoff of the 1880s. 'Help Me to Find My People' By HEATHER ANDREA WILLIAMS Reviewed by IMANI PERRY Heather Andrea Williams explores the effects of slavery's separation of black families. 'White Bread' By AARON BOBROW-STRAIN Reviewed by TAMAR ADLER A history of baking and dietary reform tells how white bread, once a symbol of American progress, became "white trash." 'Prairie Fever' By PETER PAGNAMENTA Reviewed by MIRANDA SEYMOUR Starting in the 1830s, a group of wealthy Englishmen attempted to establish a replica of home on the American plains. 'America's Great Debate' By FERGUS M. BORDEWICH Reviewed by RICHARD BROOKHISER With the rift between North and South widening, the Compromise of 1850 both staved off a civil war and made one inevitable. 'Fateful Lightning' By ALLEN C. GUELZO Reviewed by DAVID S. REYNOLDS Allen C. Guelzo details the arguments behind the Civil War. 'What Happened to Sophie Wilder' By CHRISTOPHER R. BEHA Reviewed by SARAH TOWERS A college love returns in Christopher R. Beha's first novel. 'Little Century' By ANNA KEESEY Reviewed by JONATHAN EVISON The young homesteader at the center of Anna Keesey's first novel is entangled in a range war. Fiction Chronicle By ALISON McCULLOCH A "lost novel" by Jack Kerouac, and new books by Annalena McAfee, Anne Korkeakivi, Delia Ephron and Rosie Sultan. CRIME Hopelessly Devoted By MARILYN STASIO In Jeffery Deaver's thriller "XO," a country-pop star is stalked by an obsessive fan.

BEST SELLERS Combined Print & E-Book Fiction Combined Print & E-Book Nonfiction Hardcover Fiction Hardcover Nonfiction Paperback Trade Fiction Paperback Mass-Market Fiction Paperback Nonfiction All the Lists Colin L. Powell: By the Book The former secretary of state thinks Obama should read "The Best and the Brightest," by David Halberstam. Back Page Champions of Verse By TONY PERROTTET Poets are staging events around the 2012 Olympics, but they once competed in the Games. Inside the List By GREGORY COWLES For Dave Eggers, who addresses the decline of American manufacturing in his best-selling novel "A Hologram for the King," it felt right to ensure the books were printed in the United States. Editors' Choice Recently reviewed books of particular interest. Paperback Row By IHSAN TAYLOR Paperback books of particular interest. Book Review Podcast This week, Geoffrey Ward talks about his new book, "A Disposition to Be Rich"; Julie Bosman has notes from the field; Holland Cotter discusses the artist Thomas Hart Benton; and Gregory Cowles has best-seller news. Sam Tanenhaus is the host. Scanning the Central Park Sky With Jonathan Franzen Glen Duncan Talks About 'Talulla Rising' Nora Ephron, the Queen of Quips REVIEWS BY THE TIMES'S CRITICS 'The (Honest) Truth About Dishonesty' by Dan Ariely 'Skios' by Michael Frayn 'Yes, Chef' by Marcus Samuelsson 'Hotels, Hospitals, and Jails' by Anthony Swofford 'Alif the Unseen' by G. Willow Wilson I'm Not Scared ARCHIVE Crime Columns Children's Books The New York Times Book Review: Back Issues

http://hijosdeevayadan.org/2012/06/29/humanizar-el-mundo-en-tedxdeusto/


Del blog http://hijosdeevayadan.org


Siempre lo he dicho, un profesional de cualquier rama del conocimiento que no se preocupe por tener en si mismo grandes dosis de humanismo, termina siendo un mercenario de su conocimiento y por ende de sus congeneres.

Humanizar el mundo, en TEDxDeusto

Posted on 29 junio, 2012 by Hij@s de Eva y Adán

TED es una organización sin ánimo de lucro que nació hace 28 años uniendo los mundos de la Tecnología, el Entretenimiento y el Diseño como motores para dar a conocer Ideas que Merece la Pena Difundir por su potencialidad para cambiar el mundo. Cada conferenciante es invitad@ a dar la charla de su vida en 18 minutos, que luego son compartidas a través de la web, a través de las charlas TED, subtituladas a multitud de idiomas.

Bajo dicho espíritu han surgido otras iniciativas como los eventos TEDx. Se trata de un programa de eventos locales auto-organizados que unen a personas para compartir una experiencia parecida a TED. En un evento TEDx, se combinan ponencias en directo y charlas TED en video para iniciar una discusión profunda y conexiones entre un pequeño grupo de personas. Así ha nacido TEDxDeusto, que bajo el lema Humanizar el mundo, reunirá minutos después de la publicación de esta entrada en La Comercial de la Universidad de Deusto a un importante elenco de oradores con el ambicioso objetivo de compartir historias inspiradoras acerca de cómo luchar para hacer posible el cambio por un mundo mucho más humano y justo.

De entre l@s ponentes, voy a subrayar a tres (seguro que dejando de forma inmerecida a otr@s…):

Sam Abrahams es el director de Big First Aid project y First Aid Africa, que proporciona acceso a la educación sobre atención sanitaria de emergencia en África Subsaharaiana, habiendo recibido el reconocimiento de los gobiernos de Kenia, Tanzania y Malawi por haber aportado formación básica y medios para enseñarla a más de 50.000 personas. Durante su exposición, planteará la cuestión de la igualdad en las emergencias y proporcionará su punto de vista acerca de las simples medidas que pueden tomarse para salvar vidas en todo el mundo (sin haberle oído todavía, el planteamiento me trae reminiscencias de iniciativas en nuestro entorno como #salvar1vida o #EdCivEmerg…).

Paula Farias es médico y madre de 3 hijos, habiendo acumulado una amplia experiencia en Acción Humanitaria, enGreenpeace primero y en Médicos Sin Fronterasposteriormente, en cuya Unidad de Emergencias coordinó intervenciones de emergencia en catastrofes naturales, epidemias, hambrunas y conflictos armados como los de Afganistán, Kosovo, Irak, Congo, Darfur, y otros muchos antes de ser elegida presidenta de la sección española, cargo que ocupó hasta enero de 2011. Actualmente gestiona Positive Generation, proyecto de comunicación de MSF sobre HIV-SIDA. Ya en su faceta de ex-presidenta, ha sido entrevistada recientemente por mi amiga y periodista Cristina Martínez para GEA Photowords -Eyes on the Earth, organización de fotógrafos, periodistas, escritores y cineastas, unidos con el compromiso de crear una ventana al mundo con mirada propia y responsable

Siddharth Chatterjee es Licenciado en Políticas Públicas por la Universidad de Princeton y trabaja actualmente como Jefe de Diplomacia, Relaciones Estratégicas y Relaciones Internacionales de la Federación Internacional de Sociedades de la Cruz Roja y la Media Luna Roja (IFRC) tras haber trabajado durante muchos años para la Naciones Unidas y UNICEF en Somalia, Sudán, Indonesia, Iraq y Bosnia-Herzegovina. Durante su disertación, y fruto de su experiencia como jefe de UNICEF en Sudán del Sur hace 10 años, momento en el que fue posible desmovilizar a más de 3500 niños soldado DURANTE el conflicto a través de la persuasión lenta pero determinada así como liderazgo astuto y decisivo a diferentes niveles, buscará remarcar que el mundo no puede permitirse esperar a que los conflictos acaben para empezar a retirar a los niños y niñas de los ejércitos y las milicias. Y es que el uso de niños como combatientes en los conflictos es una de las mayores violaciones de derechos humanos y su práctica todavía persiste. Siddharth piensa que debe ser misión del imperativo humanitario persuadir a los líderes políticos y militares, incluyendo actores tanto estatales como no estatales, de que el ejército no es un sitio para niños y que el uso de la diplomacia humanitaria es una herramienta muy importante para ayudar a alcanzar ese objetivo.

Para quienes no podamos asistir, existe la opción de seguir el evento en directo.

Estados Unidos activará medida anti-piratería “6 strikes” en internet este domingo

http://www.fayerwayer.com/2012/06/e-u-a-activara-medida-anti-pirateria-6-strikes-en-internet-este-domingo/

Estados Unidos activará medida anti-piratería “6 strikes” en internet este domingo

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 Rafa Garcia hace 16 horas

Hace poco les platicamos sobre la idiótica ley que pretenden impulsar en el Reino Unido sobre imponer una multa a los sospechosos de violar derechos de autor en internet y de como los ISP (proveedores de internet) tendrán que estar tomando cartas en el asunto. Pues bueno, en los Estados Unidos de América están por implementar un sistema parecido este domingo.

La regla de los “6 strikes” (como en el baseball) implica que si descargas o envias material de forma “ilegal” según el criterio inventado por alguien atrás de un escritorio, tu proovedor de internet tiene la obligación de enviarte una notificación con software para mejorar la seguridad de tu Wi-Fi (primer strike) si lo vuelves a hacer te llegaría una segunda notificación (segundo strike) y después te llega una tercera notificación que forzosamente debes leer y aceptar lo términos de la misma (tercer Strike). La cuarta notificación es muy similar a la anterior (cuarto strike) pero, lo que sigue ya es que te quiten el servicio de internet hasta que contactes a la empresa que te da el servicio para llegar a un acuerdo (quinto strike). Si vuelves a incurrir ya van de por medio abogados y acciones mas severas (sexto strike).

Además, si estás seguro de que tu no has incurrido en ningún acto ilegal, te costará USD$35 hacer que revisen tu caso y esto puede llegar incluso hasta la corte.

Si hay un país en el mundo que se jacta de tener un gran sistema de justicia es EE.UU. y son precisamente ellos los que han convertido la frase “Inocente hasta que se demuestre lo contrario” en un cliché. Es perfectamente entendible que las compañías quieran reducir la piratería porque afecta sus ventas, pero una cosa es combatir las descargas ilegales y otra muy diferenet es llevarte al consumidor puesto de corbata.

No duden que esto pronto llegue incluso, a la Suprema Corte de Justicia ya que, como hemos leído en el pasado, se necesitan muchas pruebas para dictaminar que una persona ha cometido un crimen d esta naturaleza.

Link: US ’6 Strike’ Rule Starts This Sunday, How Are You Preparing? (Zero Paid)

Telemedicina. Alerta

HDL M-HEALTH Telemedicina con tablets - Salud - YouTube Más vídeos en http://www.historiasdeluz.es Mejorar la calidad de vida de los pacientes con daño ... www.youtube.com/watch?v=gFU5pgDdlaE

Telemedicina « Loyzaga Oído y Desarrollo · Plasticidad Neural · Sociedad y Telemedicina · Historia y Genealogía · Historia de las Indias · Genealogía del Linaje de Loyzaga ... www.loyzaga.com/category/telemedicina/

Proyecto de Telemedicina de la Estrategia Digital de Salud en Chile ... Reportaje de Canal 13 sobre la Telemedicina, que permitirá llevar la salud a los lugares más ... www.youtube.com/watch?v=6Anzh2iTl38

LA TELEMEDICINA - Article at Bligoo.com » La medicina en su incansable búsqueda de soluciones que permitan solventar elproblema de salud mundial ha sido favorecida por la avanzada evolución ... www.bligoo.com/explore/article/.../LA-TELEMEDICINA.html