https://www.ortopedia-traumatologia.mx/academia/deteccion-de-microorganismos-basada-en-la-secuenciacion-del-genoma-completo-versus-selectiva-en-fluidos-sonicados-para-el-diagnostico-de-infecciones-articulares-periprotesicas/

Detección de microorganismos basada en la secuenciación del genoma completo versus selectiva en fluidos sonicados para el diagnóstico de infecciones articulares periprotésicas

agosto 17, 2022 por admin

Secuenciación de próxima generación dirigida vs «completa» aplicada a PJI de @MayoClinicINFD , ahora en @CIDJournal .

tNGS identificó el 48 % de los casos de cultivo negativo, tan bueno como sNGS y con mejor tiempo de respuesta, costo y facilidad de análisis de datos.

Targeted versus Shotgun Metagenomic Sequencing-Based Detection of Microorganisms in Sonicate Fluid for Periprosthetic Joint Infection Diagnosis | Clinical Infectious Diseases | Oxford Academic (oup.com)

• La secuenciación de próxima generación (NGS) se usa cada vez más para el diagnóstico de infecciones de las articulaciones periprotésicas (PJI), pero su utilidad clínica no está bien definida. Se ha informado que la secuenciación metagenómica completa (sNGS) identifica patógenos PJI no detectados por cultivo en fluido sonicado. Sin embargo, sNGS es complejo y costoso. Aquí, se comparó la secuenciación metagenómica dirigida (tNGS) basada en el gen del ARN ribosómico 16S (ARNr) con la sNGS de líquido sonicado para la detección e identificación microbiana en pacientes con artroplastia total de cadera (THA) y artroplastia total de rodilla (TKA).
• El tNGS basado en el gen 16S rRNA es una herramienta de diagnóstico potencial para la identificación de patógenos PJI en líquido sonicado de THA y TKA fallidos en casos de cultivo negativo, con características de rendimiento similares a sNGS.

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35944127/

https://academic.oup.com/cid/advance-article-abstract/doi/10.1093/cid/ciac646/6659052?redirectedFrom=fulltext&login=false

Hong HL, Flurin L, Thoendel MJ, Wolf MJ, Abdel MP, Greenwood-Quaintance KE, Patel R. Targeted versus Shotgun Metagenomic Sequencing-Based Detection of Microorganisms in Sonicate Fluid for Periprosthetic Joint Infection Diagnosis. Clin Infect Dis. 2022 Aug 9:ciac646. doi: 10.1093/cid/ciac646. Epub ahead of print. PMID: 35944127.

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