viernes, 29 de junio de 2012

Notiweb


Comunidad de Madrid. La Suma de Todos   Boletín informativo 'diariodeSol'
madri+d Facebookmadri+d Twittermadri+d Twittermadri+d rssmadri+d youtube
NOTIWEB MADRI+D · BOLETÍN DE NOTICIAS DE I+D 29/06/2012
NÚMERO DE SUSCRIPTORES: 60353
"Para cambiar la realidad sanitaria hay que recurrir a medidas de gestión" (MATESANZ ACEDOS, RAFAEL)
El CSIC recupera parte del genoma de dos individuos cazadores-recolectores de hace 7.000 años

Un equipo de científicos dirigido por el investigador del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) Carles Lalueza‐Fox, ha recuperado por primera vez parte del genoma de dos individuos que vivieron durante el Mesolítico, hace 7.000 años.
El etiquetado debe aclarar la diferencia entre caducidad y consumo preferente

El nuevo etiquetado de los productos, que será común para todos los países de la Unión Europea a partir de diciembre de 2014, deberá diferenciar claramente entre fecha de caducidad (a partir de la cual el alimento deja de ser seguro para la salud del consumidor) y consumo preferente.
El Delta del Ebro es más antiguo de lo que se pensaba, según una tesis

El museo de las Tierras del Ebro pretende confirmar esta tesis a través de cinco proyectos arqueológicos que se emprenderán este 2012 y que incluirán diversas prospecciones arqueológicas centradas en la desembocadura del Ebro y zonas próximas y que abarcan desde la protohistoria hasta la época medieval.
Científicos europeos crean un nuevo programa informático de código libre para las biociencias

El procesamiento de datos de imágenes biológicas nunca ha sido más sencillo gracias a un nuevo programa informático de código libre para la visualización, el tratamiento y el análisis de imágenes tridimensionales creado por un equipo de investigadores alemanes y finlandeses.
El Hierro se eleva cinco centímetros en cuatro días por la presión del magma

La energía liberada ha llegado a los 420.000 millones de julios, un dato que, junto a la deformación del terreno, evidencia la aceleración del proceso magmático en la isla canaria, en la que se observa un proceso de inflación cuyo centro está en la zona en la que se producen los movimientos sísmicos.
Las escritoras españolas de la Edad Media y la Edad Moderna, a golpe de clic

Una base de datos online de acceso abierto reúne toda la información disponible de las escritoras españolas desde la Edad Media hasta 1800.
Hallan en un meteorito un mineral desconocido para la ciencia

En 1969, una bola de fuego atravesó el cielo de México, esparciendo miles de fragmentos de meteoritos en todo el estado de Chihuahua.
El homínido A. sediba ingería alimentos duros, como cortezas y troncos de árboles

Los homínidos africanos de hace dos millones de años, a la hora de comer, en posición vertical, tenían una dieta que se diferenciaba de la del resto de los antepasados humanos conocidos, según un estudio dirigido por el Instituto Max Planck de Antropología Evolutiva en Leipzig (Alemania), en el que ha participado también la Universidad de Colorado Boulder, y que publica la revista Nature.
Una mirada verde al cielo

Finalmente no ha resultado ser una casualidad el surgimiento en España, en aquellos años tan ilusionantes como fueron los de la transición, de proyectos pioneros que apuntaban al cielo con intenciones tan distintas: la pura observación astronómica desde Calar Alto o desde la Isla de La Palma, y el aprovechamiento de una energía no contaminante desde la Plataforma Solar del desierto de Tabernas en Almería.
William Knowles, una vía para tratar el párkinson

William Knowles recibió una llamada de la Real Academia Sueca de Ciencias a mediados de octubre de 2001, llevándose una inesperada sorpresa. En aquel momento, con 84 años de edad y jubilado, se le comunicó que era galardonado con el Premio Nobel de Química por investigaciones realizadas casi cuatro décadas antes.
Blog del día: El Agua. El agua como objeto transversal en la gestión de espacios protegidos. Reflexiones.

Probablemente los recursos naturales de mayor importancia, a nivel planetario, se concentren en aquellos territorios que, por diversas razones, la sociedad ha declarado 'Espacio Natural Protegido' o 'Área Protegida', donde históricamente se han centrado los mayores esfuerzos en conservar los valores más singulares de la flora y la fauna.

mi+d tvcanalesemprendedores7PM
suplemento «iberoamérica»
Elaborado en colaboración con
CEIM

Noticias

Eventos

Enlaces

Convocatorias

Científicos europeos crean un nuevo programa informático de código libre para las biociencias

Notiweb
http://www.madrimasd.org/informacionidi/noticias/noticia.asp?id=53453&origen=notiweb&dia_suplemento=viernes



Científicos europeos crean un nuevo programa informático de código libre para las biociencias
El procesamiento de datos de imágenes biológicas nunca ha sido más sencillo gracias a un nuevo programa informático de código libre para la visualización, el tratamiento y el análisis de imágenes tridimensionales creado por un equipo de investigadores alemanes y finlandeses.
FUENTE | CORDIS: Servicio de Información en I+D Comunitario29/06/2012

ComenariosEnviar a alguienImprimir
Imprimir en blanco y negro
Compartir noticia


El software, resultado de diez años de trabajo y llamado BioImageXD, facilita el análisis de la función de células y tejidos, por ejemplo el desplazamiento de las moléculas por las superficies celulares y su unión. En la revistaNature Methods se ha publicado un artículo sobre este trabajo, financiado en parte por una subvención amparada en el Séptimo Programa Marco (7PM) de la Unión Europea.

Los investigadores, procedentes de Turku y Jyväskylä (Finlandia) y Dresde (Alemania), imprimen así un gran impulso al sector dedicado a las ciencias de la vida, al proporcionar un programa informático que permite el análisis de la composición de superficies celulares. También permite observar la propagación de células cancerosas en un entorno tridimensional y determinar la eficacia con que virus y fármacos dirigidos se introducen en las células, un logro sin precedentes.

La investigación en los campos de las biociencias y la biomedicina no deja de ganar brío gracias a los trabajos que se están realizando en imaginería celular y tisular empleando innovadores microscopios especializados. Las técnicas más avanzadas hacen posible un estudio más a fondo de células vivas.

Sin embargo, para que se puedan mostrar adecuadamente, las imágenes microscópicas se tienen que transformar en modelos tridimensionales. Así pues, aunque dichas imágenes tridimensionales ofrecen información fundamental, para contar con datos científicos fiables se necesitan valores numéricos que puedan emplearse en cálculos matemáticos aplicados a su vez a extensos corpus de datos. 

En este contexto es donde cobra sentido la labor de dichos científicos alemanes y finlandeses, quienes han elaborado especificaciones precisas del software para procesar datos de imagen. Partieron de la premisa de que el programa estuviera basado en código libre al que pudieran acceder fácilmente todo tipo de investigadores, y así es como surgió BioImageXD.

Este recurso ayudará a generar métodos analíticos radicalmente nuevos, procesar innumerables imágenes de forma simultánea y analizar millones de moléculas. Según sus creadores, las pruebas comparativas que realizaron mostraron que BioImageXD es más rápido y preciso que otros programas similares.

La labor de creación de esta herramienta comenzó hace aproximadamente una década de manos de un equipo de investigación de la Universidad de Jyväskylä dirigido por Jyrki Heino. En este tiempo, los investigadores han cooperado para racionalizar y optimizar el software. Al cargo de las tareas de desarrollo, en el marco del proyecto, estuvo Pasi Kankaanpää, que en la actualidad trabaja en el Centro de Biotecnología de Turku como coordinador del «Centro de Imagen Celular» (Cell Imaging Core) de Finlandia. 

El trabajo contó también con el apoyo de la Academia de Finlandia y de la Agencia Finlandesa de Financiación de la Tecnología y la Innovación.





What is BioImageXD?
BioImageXD is a free open source software project for analyzing, processing and visualizing of multi dimensional microscopy images. It's a collaborative project, designed and developed by microscopists, cell biologists and software engineers from the Universities of Jyväskylä and Turku in Finland, Max Planck Institute CBG in Dresden, Germany and collaborators worldwide.
Implementation
BioImageXD is written in Python and C++, using wxPython for the GUI, and leverages the power of the Visualization Toolkit (VTK) for multi dimensional image processing and 3D rendering. BioImageXD also uses the Insight Segmentation and Registration Toolkit (ITK) for segmentation and other image processing tasks. BioImageXD works on Linux (or theoretically any UNIX-like OS with wxPython, VTK and ITK), Mac OS X 10.6/10.7, and Windows XP, Vista and 7. The first Windows beta version of BioImageXD was released on the 9th February of 2006. See the download section for releases of the software.
BioImageXD main features
BioImageXD is a multi-purpose post-processing tool for bioimaging. The software can be used for simple visualization of multi-channel temporal image stacks to complex 3D rendering of multiple channels at once. Animations of 3D renderings can be created using flying paths or keyframes. BioImageXD has basic image adjustment operations and a collection of noise reduction methods. Processing methods are accompanied with a selection of segmentation methods. Segmentation results can be analysed for tens of parameters or used for motion tracking. Other quantitative analysis methods include for instance voxel and object colocalization methods and internalization analysis. All processing and analysis methods can be build into pipelines and run for hundreds of datasets at once in batch processor.

Download


The latest and older versions of the software are always available at the SourceForge page. The bug tracker can also be found there, please use it. The latest packages of the software are:
Mac OS X 10.6/10.7 64-bit packageDownload BioImageXD 1.0 Release Candidate 3 (r1789)
Installation instructions, Windows
Windows packages are distributed as installers. Just run the installer and follow coming instructions to install BioImageXD to your system. You might need system administrator rights depending on your system settings.
Installation instructions, Linux
Linux package is not yet distributed as installer and it has prerequisite of Python 2.6 and wxPython 2.8.x installed in the system. To install BioImageXD on Linux, download the Linux package and extract it to the directory where you want to install BioImageXD. Then follow instructions on readme_linux.txt to set LD_LIBRARY_PATH. After setting that environment variable, you are ready to run BioImageXD using command python BioImageXD.py.
Installation instructions, Mac OSX
Mac OSX package is not yet distributed as disk image, we are working on it. Also the Mac OSX package currently uses different version of wx GUI library than Windows or Linux packages, so there can be some GUI related bugs in OSX version. To install and use BioImageXD in Mac OSX, you need to have at least a basic knowledge of shell (terminal.app). Mac OSX 10.6/10.7 package requires Python 2.7 installed in the system, everything else is included in the package. After you have downloaded the BioImageXD package and extracted it (in terminal use command tar xzf BXD_package_name.tar.gz), read file readme_osx.txt for instructions to set DYLD_LIBRARY_PATH. If you have extracted BioImageXD to /Users/username/BioImageXD then for instance you only need to set the following two lines to file /Users/username/.bash_profile:
BXD_PATH=/Users/username/BioImageXD
export DYLD_LIBRARY_PATH=$DYLD_LIBRARY_PATH:${BXD_PATH}/Libraries/:${BXD_PATH}/Libraries/python2.7/site-packages/vtkbxd/:${BXD_PATH}/Libraries/vtk-5.6/:${BXD_PATH}/Libraries/InsightToolkit/
After that BioImageXD can be launched in the BioImageXD directory using command python2.7 BioImageXD.py in every new terminal application.
Source codeYou can access the source code through the SourceForge subversion service.
The repository can be accessed at the following URL: https://bioimagexd.svn.sourceforge.net/svnroot/bioimagexd/bioimagexd/trunk.
Sample data
Sample data can be downloaded from SourceForge. Sample data package includes one 3D and one 4D LSM stack of two channels.
Manual
Both getting started guide and manual of BioImageXD are available. We recommend new users to first try getting started guide which is newer, up-to-date and more descriptive.Getting started guide is also included in BioImageXD software packages. Manual is old and not up-to-date, but has some in depth information (like descriptions of colocalization results) not available in getting started guide.

El Sentido de las bibliotecas en la sociedad.



  
     
 Por: LUZ ORDÓÑEZ Socióloga y Comunicadora Social. epri.cci@gmail.com / www.uramanta.org | 28/06/2012 | Ed. Imp.
 
El próximo 30 de junio, se conmemora el “Día del bibliotecario boliviano” impulsado por el III congreso de Bibliotecología, Archivística y Museología el año 2006, e instituido por Resolución Ministerial 511/07, en homenaje al decreto, dispuesto por el Mariscal Andrés de Santa Cruz y Calahumana de crear bibliotecas públicas en Bolivia en 1830. 

En su tiempo se instauró con la visión de fortalecer el crecimiento integral, fomento a la lectura y formación de los ciudadanos, aunque debido a las condiciones sociales propias de la época, era un privilegio para algunas personas, asistir a una de ellas. Sin embargo poco a poco estos espacios se fueron ampliando y democratizando en su uso, a medida que la educación, el alfabetismo y la implementación de diferentes políticas sociales fueron extendiéndose en el país. 

Un bibliotecario es un gestor cultural y una biblioteca es un espacio de información y saber, acumulado durante varios años y siglos de nuestra historia, compartiendo a los lectores un conocimiento perfeccionado a través del tiempo. Cada una de nuestras bibliotecas deposita una vasta información que se constituye en parte del patrimonio cultural de nuestro país, transmitido de generación en generación, su utilización nos permite comprender el por qué de las cosas, identificar problemas y plantear soluciones. 

En la actualidad mantener abierta una biblioteca se convierte en un verdadero desafío, frente actitudes de algunas personas que cuestionando la funcionalidad de una biblioteca, dentro de una unidad educativa de nuestra ciudad, pretendan cerrarla, bajo el pretexto de que “no hay muchos usuarios” y que frente al internet la biblioteca, estaría quedando obsoleta, ahorrando de esa forma los presupuestos para su mantenimiento y orientando esos recursos a la compra de un equipo de sonido, que según evalúan, sería más útil para los estudiantes. La función social de una biblioteca no ha culminado ante la aparición de nuevas tecnologías, el internet es solamente un medio más, en cambio las bibliotecas son puntos culturales de referencia, económica, social, histórica, política, religiosa. etc.

Una biblioteca cumple diferentes funciones dentro la sociedad, entre ellas la educación, pues constituye un apoyo complementario al trabajo que vienen desarrollando los profesores en el aula, incentivando la lectura; también cumple una función socializadora, no solamente de conocimiento, sino también crea una dinámica de intercambio entre autor y lector; por otro lado, es un espacio de transmisión cultural, porque proporciona conocimientos y saberes, ya sea locales o internacionales, es una ventana hacia el mundo; y finalmente cumple con la función recreativa, mediante actividades lúdicas y de exploración promueve hábitos de lectura. 
Fuente:http://www.opinion.com.bo/opinion/articulos/2012/0628/noticias.php?id=61740

Books Update



The New York Times

June 29, 2012

Books Update

On the Cover of Sunday's Book Review


'America the Philosophical'

By CARLIN ROMANO
Reviewed by ANTHONY GOTTLIEB
Carlin Romano's ambitious book argues that today's America is the best place there has ever been to do philosophy, surpassing even the Athens of Socrates, Plato and Aristotle.

Also in the Book Review

Thomas Hart Benton

'Thomas Hart Benton: A Life'

By JUSTIN WOLFF
Reviewed by HOLLAND COTTER
Justin Wolff's look at the life of the painter Thomas Hart Benton doesn't shy away from ambiguity.

'A Disposition to Be Rich'

By GEOFFREY C. WARD
Reviewed by T. J. STILES
Geoffrey C. Ward's great-grandfather, who ran a pyramid scheme, was the Bernie Madoff of the 1880s.
Charlie Crump, a former slave from North Carolina, and his granddaughter.

'Help Me to Find My People'

By HEATHER ANDREA WILLIAMS
Reviewed by IMANI PERRY
Heather Andrea Williams explores the effects of slavery's separation of black families.
Avisco cellophane advertisement, 1958.

'White Bread'

By AARON BOBROW-STRAIN
Reviewed by TAMAR ADLER
A history of baking and dietary reform tells how white bread, once a symbol of American progress, became "white trash."
Using a light English saddle to hunt bison, from Grantley F. Berkeley's

'Prairie Fever'

By PETER PAGNAMENTA
Reviewed by MIRANDA SEYMOUR
Starting in the 1830s, a group of wealthy Englishmen attempted to establish a replica of home on the American plains.
Masters of the Senate: From left, Daniel Webster, Henry Clay and Stephen A. Douglas.

'America's Great Debate'

By FERGUS M. BORDEWICH
Reviewed by RICHARD BROOKHISER
With the rift between North and South widening, the Compromise of 1850 both staved off a civil war and made one inevitable.
Image of poster from New-York Historical Society.

'Fateful Lightning'

By ALLEN C. GUELZO
Reviewed by DAVID S. REYNOLDS
Allen C. Guelzo details the arguments behind the Civil War.

'What Happened to Sophie Wilder'

By CHRISTOPHER R. BEHA
Reviewed by SARAH TOWERS
A college love returns in Christopher R. Beha's first novel.
Anna Keesey

'Little Century'

By ANNA KEESEY
Reviewed by JONATHAN EVISON
The young homesteader at the center of Anna Keesey's first novel is entangled in a range war.
ELLSWORTH KELLY: PLANT DRAWINGS, 1948-2010Edited by Marla Prather and Michael Semff.239 pp. Schirmer/Mosel. $95.This collection of plant drawings, which have long been integral to Kelly's work, accompanies a current exhibition at the Metropolitan Museum of Art. Above,

Fiction Chronicle

By ALISON McCULLOCH
A "lost novel" by Jack Kerouac, and new books by Annalena McAfee, Anne Korkeakivi, Delia Ephron and Rosie Sultan.

CRIME

Hopelessly Devoted

By MARILYN STASIO
In Jeffery Deaver's thriller "XO," a country-pop star is stalked by an obsessive fan.

Colin L. Powell

Colin L. Powell: By the Book

The former secretary of state thinks Obama should read "The Best and the Brightest," by David Halberstam.

Back Page


Champions of Verse

By TONY PERROTTET
Poets are staging events around the 2012 Olympics, but they once competed in the Games.
Dave Eggers

Inside the List

By GREGORY COWLES
For Dave Eggers, who addresses the decline of American manufacturing in his best-selling novel "A Hologram for the King," it felt right to ensure the books were printed in the United States.

Editors' Choice

Recently reviewed books of particular interest.

Paperback Row

By IHSAN TAYLOR
Paperback books of particular interest.

Book Review Podcast

This week, Geoffrey Ward talks about his new book, "A Disposition to Be Rich"; Julie Bosman has notes from the field; Holland Cotter discusses the artist Thomas Hart Benton; and Gregory Cowles has best-seller news. Sam Tanenhaus is the host.
ArtsBeat